L'école de VILLARDS-D'HERIA fait partie d'un regroupement pédagogique intercommunal (RPI) MARTIGNA-MONTCUSEL-VILLARDS-D'HERIA avec une école à MARTIGNA et une école à VILLARDS-D'HERIA.
À VILLARDS-D'HERIA sont scolarisés les élèves de Maternelle et de CE2, CM1, CM2 en 2 classes.
À MARTIGNA sont scolarisés les élèves de CP et CE1.
Les communes du RPI ont signé, en 2023, avec la Préfecture du Jura et les Services de l'Education Nationale une convention dite "de ruralité" afin de garantir une offre scolaire de qualité pour les élèves de nos communes. Cette convention est valable pour 3 années scolaires et pourra être reconduite après évaluation par les différentes parties.
Un transport scolaire est assuré par la Région Bourgogne Franche-Comté, entre les 3 communes du RPI. Les horaires de la ligne sont disponibles ICI.